Después de asumir su cargo como Thomaskantor a finales de mayo de 1723, Su primer ciclo de cantatas transcurrió desde el primer domingo después de la Trinidad de 1723 hasta el domingo de la Trinidad el año siguiente. Por ejemplo, la cantata Herz und Mund und Tat und Leben, BWV 147, pertenece a este primer ciclo. El ciclo de cantatas de su segundo año en Leipzig se llama el ciclo de cantatas corales ya que consiste principalmente en obras en el formato de cantata coral. Su tercer ciclo de cantatas se desarrolló durante un período de varios años, seguido por el ciclo Picander de 1728 a 1729.
Las cantatas de iglesia posteriores incluyen las cantatas corales Ein feste Burg ist unser Gott, BWV 80 (versión final) y Wachet auf, ruft uns die Stimme, BWV 140. Solo se conservan en mayor o menor medida los primeros tres ciclos de Leipzig. Además de sus propias obras, Bach también interpretó cantatas de Telemann y de su pariente lejano Johann Ludwig Bach.